书名：生物信息学中的计算机技术

作者：Cynthia Gibas, Per Jambeck 著

译者：孙超, 郭庆民, 刘相国, 吴斌 译

国内出版社：中国电力出版社

出版时间：2002年07月

页数：448

书号：7-5083-1052-7

原版书出版商：O'Reilly Media

 

Cynthia Gibas是位于弗吉尼亚州Blackburg的弗吉尼亚理工学院的生物学副教授。她在计算生物学受到青睐之前就已经是计算生物学家了。目前她正在推动全新的家庭Linux集群。她的研究兴趣包括基因组结构和进化、蛋白质表面和界面特性，以及蛋白质结构预测。她为生物学家们讲授生物信息学方法的课程。她正期盼着下一个假期的来临，可能在2006年的某个时候。

Cynthia Gibas is an assistant professor of biology at Virginia Tech, in Blacksburg,Virginia. She's been a computational biologist since before computational biology was cool, and is currently learning to drive her spankin' new home-built Linux cluster. Her research interests include the structure and evolution of genomes, the properties of protein surfaces and interfaces, and prediction of protein structure. She teaches introductory courses in bioinformatics methods for biologists and islooking forward to her next real vacation, sometime in 2006.

 

 

 

Per Jambeck是加州大学圣迭戈分校生物工程系的博士研究生。他从1994年开始从事计算生物学的研究，兴趣主要集中在如何将机器学习应用于多维生物学数据的理解。在谈及空闲时间时，Per总是充满渴望地微笑着，他时常组织主持社区演出和学生广播站。

Per Jambeck is a Ph.D. student in the bioengineering department at the University of California, San Diego. He has worked on computational biology problems since 1994, concentrating on machine learning applications in understanding multidi-mensional biological data. Per smiles wistfully at the mention of free time, but he manages to host shows at community and student-run radio stations anyway.

 

 

本书封面上的动物是一种很小的线虫，Caenorhabditis elegan，与它的那些肮脏的近亲不同，这种线虫生活在土壤中，靠微生物和细菌为生。它大概能长到1毫米长。
尽管是一种原始的生物，这种动物在本质上却和人类有着许多相同的生物学特征。C. elegan的生命是从单细胞开始的，经分裂长成多细胞的成熟个体。它有神经系统和脑（更确切地说是围咽环，circumpharyngeal ring）以及支持运动的肌肉系统。它有一定的行为，能进行简单的学习。与人类一样，它也分为两性，但它分为雄性和自体受精的雌雄同体。C. elegan在实验室条件下很容易大量生长，寿命只有短短的2~3周，可在复杂的实验中对它进行操作。这些特性使得它成为进行科学研究的理想生物。
雌雄同体的C. elegan有959个细胞，300个是神经元，81个是肌肉细胞。通过发育学研究，完整的细胞世系已经搞清楚了。成体头部有大量感受味觉、嗅觉、触觉和温度的感觉器官。虽然没有眼睛，但它对光有轻微的反应。C. elegan有大概17800个不同的基因，它的基因组已全部测序。与果蝇、小鼠、拟南芥菜一起，C. elegan已成为自Sydney Brenner几十年前首次注意这种生物以来、生物学中最常见的模式生物之一。